La Federació de Cooperatives de Treball té els seus orígens en la Federació de Cooperatives de Producció i Treball de Catalunya, fundada l’any 1935 com una agrupació voluntària i solidària de cooperativistes.
El 1982 es crea la Federació de Cooperatives de Treball Associat de Catalunya (FCTAC) i un any més tard, el Parlament promulga la Llei de cooperatives catalana. Cap a 1986 apareix la Federació d’Associacions de Cooperatives de Treball Associat (FACTA), que també agrupa cooperatives de treball.
No serà fins el 1999 que apareix la Federació de Cooperatives de Treball de Catalunya (FCTC) tal i com la coneixem avui, fruit de la fusió de la FCTAC i la FACTA.